Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRFP10586 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRFP10586 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms