Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3DP05423 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3DP05423 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms