Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT1P04264 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT1P04264 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT1P04264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT1P04264 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT1P04264 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT1P04264 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT1P04264 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT1P04264 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT1P04264 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT1P04264 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT1P04264 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT1P04264 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT1P04264 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT1P04264 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT1P04264 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT1P04264 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT1P04264 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT1P04264 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms