Protein–RNA interactions for Protein: O95757

HSPA4L, Heat shock 70 kDa protein 4L, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4LO95757 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSPA4LO95757 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4LO95757 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms