Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE6O95741 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms