Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBOX1O75936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBOX1O75936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBOX1O75936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms