Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOPO43791 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOPO43791 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPOPO43791 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPOPO43791 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPOPO43791 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOPO43791 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOPO43791 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOPO43791 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOPO43791 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOPO43791 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOPO43791 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOPO43791 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOPO43791 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOPO43791 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOPO43791 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms