Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR3O43761 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms