Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLX3O43711 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLX3O43711 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLX3O43711 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLX3O43711 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLX3O43711 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLX3O43711 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLX3O43711 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLX3O43711 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLX3O43711 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLX3O43711 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLX3O43711 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLX3O43711 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLX3O43711 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLX3O43711 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLX3O43711 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLX3O43711 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms