Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQV1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQV1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQV1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQV1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQV1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQV1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms