Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC5

C3orf70, UPF0524 protein C3orf70, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf70A6NLC5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf70A6NLC5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C3orf70A6NLC5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C3orf70A6NLC5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf70A6NLC5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms