Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM49BA6NDI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49BA6NDI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms