Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRD1A4D1F6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms