Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLRN2A0PK11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLRN2A0PK11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms