Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MESP1Q9BRJ9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms