Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms