Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H3F3CQ6NXT2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3CQ6NXT2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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