Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms