Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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