Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms