Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms