Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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