Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CUL1Q13616 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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