Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NDUFS3-204ENST00000525378 779 ntTSL 214.36□□□□□ -0.112e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFS3-205ENST00000527178 269 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFS3-203ENST00000525212 530 ntTSL 28.53□□□□□ -1.042e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 COA4-206ENST00000545127 922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 312.71□□□□□ -0.375e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.95e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.38e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 229.29■■■□□ 2.281e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 420.02■□□□□ 0.81e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 418.65■□□□□ 0.581e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.553e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.113e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.373e-24■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.551e-14■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-205ENST00000467117 687 ntTSL 214.82□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-201ENST00000355749 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-203ENST00000459880 599 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-204ENST00000466896 778 ntTSL 312.28□□□□□ -0.443e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.253e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NDUFA5-202ENST00000378795 1360 ntTSL 25.78□□□□□ -1.483e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 511.67□□□□□ -0.545e-20■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 AMFR-202ENST00000492830 2249 ntTSL 214.81□□□□□ -0.044e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 KRT8-206ENST00000546900 523 ntTSL 324.52■■□□□ 1.522e-54■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 516.63■□□□□ 0.252e-54■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.418e-28■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ATP5L-208ENST00000534385 623 ntTSL 29.32□□□□□ -0.922e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.618e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.738e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-205ENST00000518218 717 ntTSL 28.48□□□□□ -1.058e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.458e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.478e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 221.95■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 COPS6-206ENST00000468499 745 ntTSL 321.91■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TPT1-205ENST00000442760 902 ntTSL 224.56■■□□□ 1.521e-54■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 24e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 CFL1-213ENST00000532134 855 ntTSL 515.75■□□□□ 0.117e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.881e-25■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.797e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-211ENST00000550779 2099 ntTSL 519.94■□□□□ 0.787e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.627e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.577e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.317e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.237e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 218.84■□□□□ 0.613e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ERGIC3-219ENST00000496172 781 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ERGIC3-214ENST00000482338 598 ntTSL 210.01□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.814e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 UQCRC2-205ENST00000563898 1406 ntTSL 58.29□□□□□ -1.084e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 UQCRC2-203ENST00000561798 699 ntTSL 28.19□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.721e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NDUFB2-205ENST00000464564 469 ntTSL 519.74■□□□□ 0.751e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NACA-213ENST00000549855 711 ntTSL 512.46□□□□□ -0.419e-23■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.383e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)19.08■□□□□ 0.652e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.652e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HIGD1A-205ENST00000470543 983 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AC099329.1-201ENST00000625589 539 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 RPL13A-205ENST00000474171 521 ntTSL 213.57□□□□□ -0.249e-23■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HSBP1-204ENST00000570259 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.912e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.762e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.934e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.054e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 USP47-201ENST00000305481 3577 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.244e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 USP47-208ENST00000529813 3123 ntTSL 25.5□□□□□ -1.534e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 HINT1-209ENST00000513345 656 ntTSL 218.8■□□□□ 0.64e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NMT1-206ENST00000587670 537 ntTSL 318.11■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 RPL24-205ENST00000488288 1857 ntTSL 211.53□□□□□ -0.568e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 520.38■□□□□ 0.856e-13■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 10.3
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