Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms