Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms