Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms