Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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