Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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