Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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