Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms