Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TO15178 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TO15178 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TO15178 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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