Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ5

SACM1L, Phosphatidylinositide phosphatase SAC1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACM1LQ9NTJ5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SACM1LQ9NTJ5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SACM1LQ9NTJ5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms