Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms