Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms