Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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