Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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