Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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