Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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