Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms