Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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