Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms