Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF628Q5EBL2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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