Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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IKZF1Q13422 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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