Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms