Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THOP1P52888 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
THOP1P52888 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms