Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F12Q9HCS2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms