Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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