Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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