Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms